La organización de AITEMIN se basa en la siguiente estructura:
Constituida por todos los asociados de AITEMIN, es el órgano supremo de gobierno, que se reúne anualmente en asamblea ordinaria.
El Consejo Rector es el responsable de la gestión de la Asociación, y en él están representados los principales sectores y tipos de socio que la componen. El Consejo Rector está compuesto por:
Está constituida por los medios humanos y materiales para llevar a cabo las actividades de la Asociación, y está estructurada en varios Departamentos y Áreas tecnológicas. La plantilla actual abarca un gran abanico de profesionales, incluyendo ingenieros, geólogos, químicos, arquitectos, etc., así como técnicos de formación profesional.